金融工程系依托应用经济学江苏省重点建设学科和盐城市金融研究院等资源优势，开设金融工程专业，于2014年9月正式面向全国招收本科生，2018年获得学士学位授予权并通过专业学位评估，2022年高质量通过省专业综合评估，2025年成为学校数字经济硕士点申报的重要方向之一。
金融工程专业的办学定位是立足江苏，面向全国，旨在培养有国际视野、有金融思维、有全局意识、有创新观念的高素质金融人才。办学特色是聚焦金融发展前沿和地方经济发展需求，集扎实的金融理论知识培养、熟练的金融实务操作能力提升、坚实的金融数据分析能力强化和突出的人工智能与综合创新能力提高于一体，为区域金融发展、金融行业改革与数字金融创新服务，培养能够从事金融理论与业务操作、资产定价与风险管理、投融资管理与数字金融管理等方面工作的高素质应用人才。
金融工程系师资团队较强，现有专任教师12人，其中教授2人、副教授4人、讲师6人。具有博士学位的教师7人，在读博士3人。12名教师中9名具有金融专业教育背景、2名具有工科专业教育背景，3名具有国外留学经历。教师队伍年龄结构合理、职称结构合理。
金融工程系近五年在教学与科研方面取得了丰硕的成果。教学方面：专业老师指导本科生毕业论文获江苏省本科单篇优秀毕业论文三等奖1项；校优秀毕业论文团队奖2项，校优秀毕业论文（单篇）一等奖2项、二等奖2项、三等奖3项。金融工程系强化以赛促学，注重学生创新能力培养。近5年金融工程系的师生在各类大学生创新创业竞赛和学科竞赛中屡获佳绩，获全国大学生金融科技创新大赛、全国高校商业精英挑战赛、全国企业竞争模拟大赛等A类赛事的国家级奖励10余项、省级奖励20余项，获“东方财富杯”全国大学生金融精英挑战赛等B类赛事的国家级奖励20余项、省级奖励30余项。
科研方面：季健教授主持完成国家社科基金后期资助项目1项，郑志来教授主持国家社科基金项目1项、省部级项目2项，华志芹老师主持完成省部级项目1项；全系教师主持完成各类市厅级课题10余项，横向科研经费累计到账300余万元。近五年，全系教师共发表学术论文20余篇，其中中文核心及以上期刊10篇，出版专著2部。研究成果获得江苏省哲学社会科学界第十二届、第十三届学术大会优秀论文二等奖、三等奖，盐城市第十四次哲学社会科学优秀成果一等奖；撰写的决策咨询报告获得省级主要领导肯定性批示3个，市级主要领导肯定性批示4个。